Федеральное государственное бюджетное учреждение «Cеверо-Западное бассейновое управление по рыболовству и сохранению водных биологических ресурсов» находится в ведении Федерального агентства по рыболовству (Росрыболовства).
Учреждение является некоммерческой организацией, созданной Российской Федерацией для выполнения работ, оказания услуг в целях обеспечения реализации предусмотренных законодательством Российской Федерации полномочий Федерального агентства по рыболовству в сфере рыболовства и сохранения водных биоресурсов.